Ze względu na zasady księgowania wg metody wyceny FIFO anulowanie dokumentu zawierającego towary wg FIFO może spowodować uruchomienie księgowania specjalnego: jeśli dokument zawiera towary FIFO, dla których magazyny są inne, niż te w dokumentach bazowych, a koszty towarów w magazynach również są inne, nie można przywrócić poprzez anulowanie oryginalnych sald kont różnic cenowych oraz COGS (koszt towarów sprzedanych).