Účtovné princípy metódy ocenenia FIFO môžu spôsobiť, že stornovanie dokladu s materiálmi FIFO vyvolajú osobitné účtovanie: Ak doklad obsahuje materiály FIFO, ktorých sklady sa líšia od skladov v základných dokladoch a materiálové náklady v skladoch sú rozdielne, účet cenových rozdielov a účet nákladov predaja (COGS) sa nemôže stornovaním vrátiť na pôvodné zostatky.