Databáza systému SAP Business One ukladá všetky dáta, ktoré boli definované v systéme. Sú to dáta napríklad pre odberateľov, materiál alebo faktúry v rôznych databázových tabuľkách.

Každá tabuľka ukladá relevantné dáta príslušného objektu. Do tabuľky faktúr sa ukladá číslo faktúry, číslo a názov odberateľa, dátum založenia, počet predaných položiek, faktúrovaná čiastka atď.

Počas tohto procesu sa rozlišuje, či dáta zahŕňajú hlavičku faktúry alebo riadky s predanými položkami. Tieto dva typy dát sa uložia oddelene do príslušnej tabuľky v databáze.