Huvudmeny: Modulflik 
Registret Moduler innehåller alla SAP Business One-moduler:
Innehåller grundläggande systeminställningar för valutakurser, systeminställningar och behörigheter samt inställningar för online-varningar och funktioner för import och export av data.
Här hanterar du redovisningsdata och kontoplaner, huvudboken, aktuella bokföringsbokningar och rapportering. Du kan också definiera budgetar och resultatenheter för effektiviserad hantering av företagets intäkter och kostnader.
Här kan försäljningsmedarbetarna hantera sina affärsmöjligheter och analysera försäljningsinformationen. Modulen innefattar också prognosrapporter, vunna affärsmöjligheter, en pipeline för affärsmöjligheter och dynamisk visning av försäljningsnivåer.
Här hanteras alla aspekter av försäljningsprocessen, från registrering av offerter, kundorder och leveranser, till utfärdande av kundfakturor och returer. Du kan också lägga upp basdokument för måldokument eller skicka brev till kunder som har öppna skulder.
Här hanterar du dina leverantörstransaktioner. Du kan avbilda hela inköpsprocessen, från inköpsorder till leverantörsfakturering. Med anskaffningsprisfunktionen kan företag som importerar varor beräkna varornas inköpspriser, inklusive tullavgifter, transport- och försäkringskostnader, avgifter, skatter och andra kostnader.
Här lagras basdata om alla affärspartner, inklusive information om kunder, återförsäljare, leverantörer och intressenter. Du kan också lagra aktivitetsinformation för affärspartner och data för försäljningsvolymprognoser.
Här hanteras alla penningtransaktioner. Dessutom kan du använda betalningsmotorn för bearbetning av automatiska betalningar.
Här hanterar du lager och information om lagersaldon, prislistor, specialprisavtal, alternativa artiklar och lagertransaktioner samt pris- och förpackningsprocesser och parti- och serienummer.
Här hanterar du stycklistor och produktionsorder.
För effektiv materialbehovsplanering i tillverkningsprocessen. Med en planeringsguide definierar du planeringsscenarion för befintliga lagernivåer, kundorder, beställningar, produktionsorder och prognoser. Därmed kan du skapa materialbeställningsrekommendationer, så att du kan uppfylla kundernas behov.
För hantering av kontakten mellan servicepersonal och kunderna. I servicemodulen kan du föra in och underhålla information om serviceavtal, artiklar och serienummer, reklamationer och frågor från kunder samt utföra ett flertal närliggande funktioner. Varje gång en kund rapporterar ett problem registrerar du det genom att generera ett serviceavrop.
Här hanterar du information om företagets medarbetare, och använder personalrelaterade funktioner. Modulen har funktioner för personaladministration, inklusive detaljerad medarbetarinformation, kontaktinformation och frånvarorapporter.
Här kan du sammanställa rapporter där företagsinformationen visas exakt som du vill. Här inkluderas företagsinterna utvärderingar, lagerrapporter, bokslutsrapporter och bokföringsuppgifter. Utöver de fördefinierade rapporterna kan du definiera egna rapportfrågor.